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香港大学黄适团队：恒河猴胃肠道“高清地图”，不同部位藏着哪些细菌？

整合宏基因组、2bRAD-M及靶向胆汁酸代谢组学，利用恒河猴全胃肠道148个腔内与黏膜样本构建灵长类空间分辨微生物组图谱并与人类样本对照。

西湖大学鞠峰团队NC：AI结合三维结构预测，解锁RNA病毒暗物质

针对宏转录组中RNA病毒依赖RNA的RNA聚合酶（RdRp）序列极度发散及长度异质的检测难题，开发整合蛋白质语言模型序列初筛与滑动窗结构比对的两阶段深度学习框架Rider。

天津医科大学总医院刘天宇/李凌峰等：共生菌鞭毛蛋白给肠黏膜穿上糖衣

针对溃疡性结肠炎黏液屏障受损机制未明的问题，结合临床队列与DSS/TNBS结肠炎小鼠模型探究毛螺菌科细菌3-1-57及其鞭毛蛋白（Fla）的作用机制。

上海六院贾伟/李梦慈等Cell：为何女性肝脏更受保护？揭示肠道菌群与胆汁酸的关键作用

针对女性对慢性肝病天然保护机制不明的问题，整合9254人代谢组及多队列宏基因组与小鼠模型解析了性二态性肝保护通路。

西农刘学波团队：植物乳植杆菌如何与肠神经“对话”改善结肠炎？

针对溃疡性结肠炎中肠道菌群与肠神经系统互作机制不明的问题，结合临床队列、小鼠模型及遗传工具鼠解析其保护机制。

南科大刘小敏团队：从基因组结构变异到功能代谢，解码肠道菌群因果轴

针对宿主结构变异（SV）影响肠道微生态与代谢机制不明的问题，基于2002名中国成年人高深度全基因组、宏基因组及血液代谢组数据展开系统关联与因果推断分析。

吉林大学曹永国/屈琳凯等Cell子刊：AKK菌产酪醇，抵御子宫内膜炎

针对生殖系统子宫内膜炎的菌群调控机制不明问题，结合临床患病奶牛样本、粪菌移植、小鼠大肠杆菌感染模型及非靶向代谢组学展开机制探究。

江南大学孙嘉/潘礼龙等：一类特殊的大肠杆菌，推动慢性胰腺炎走向纤维化

针对慢性胰腺炎（CP）纤维化机制及肠道菌群因果作用不明的问题，整合多中心CP患者宏基因组、小鼠模型与巨噬细胞实验解析致病菌群机制。

湖南师大杨焕胜团队：丁酸梭菌与精氨酸联手，熄灭促肥胖巨噬细胞炎症

针对菌群失调驱动代谢性炎症机制未明的问题，整合肥胖宁乡猪、长尾猕猴与小鼠模型及多组学技术展开解析。

内农大张文羿/张猛等：肠道微生态干预耐力表现，男女运动员响应大不相同

针对耐力运动员高负荷训练适应需求，开展两阶段随机双盲对照试验，评估益生菌联合酵母提取物（CPYE）干预6周及强化训练延长期对生理表型与肠道微生态的影响。

港中大黄秀娟/徐之璐等GUT：同一种肠道菌，与肌少症关联因糖尿病而异

针对肠道菌群与肌少症关联在不同人群中是否一致的疑问，横断面分析2994名社区老年人队列中180人的粪便宏基因组及血浆代谢组数据。

南方医院刘克玄/邓凡等Cell子刊：肠道菌群释放柚皮素，减轻术后胃肠损伤

针对心脏术后急性胃肠损伤问题，整合临床队列、无菌小鼠肠缺血再灌注模型及类器官体系开展机制解析。

北京朝阳医院刘心娟团队：捕捉菌群表型可塑性，预测溃疡性结肠炎

针对溃疡性结肠炎（UC）中菌群表型可塑性调控机制不清的问题，本研究采用UC患者-健康配偶配对队列，结合idopNetwork建模与功能聚类解析微生物互作网络。

天津大学乔建军/吴胜波等：膳食多酚靶向群体感应，阻断病原菌通讯网络

针对耐药病原菌群体感应干预需求，整合图神经网络从超7000种植物化学物中筛选并多层级解析膳食多酚靶向自诱导分子-2（AI-2）通路的机制。

赵文婧/唐啸宇/牟相宇等Nature：拟杆菌如何保护心血管？关键代谢物被锁定

针对拟杆菌属减少与动脉粥样硬化相关但分子机制不明的问题，结合宏基因组分析、Apoe−/−小鼠模型与活性导向分离，解析单形拟杆菌的抗动脉粥样硬化机制。

医科院放射所樊赛军/丁旭东等：牛磺酸防辐射护肠道，男女机制大不同

针对放射性肠损伤缺乏安全防护剂的问题，利用小鼠全腹照射模型结合多组学解析了牛磺酸介导肠道保护的性别差异机制。

海南大学张家超/沈思源等Cell子刊：减毒增效，益生菌LGG代谢物助攻肺癌靶向治疗

针对吉非替尼治疗非小细胞肺癌伴随的胃肠道及肝毒性问题，利用益生菌筛选、多组学分析及人源肠-肝-肿瘤类器官芯片探索了微生物干预策略。

港中大张翔团队Cell Metab：脂肪肝癌变新推手，真菌代谢物如何促癌？

针对MASLD向HCC进展机制不清的问题，整合小鼠多模型、人源细胞及三个人群队列系统解析肠道真菌的作用。

中科院亚热带生态所周锡红/胡竑等：丁酸梭菌投递小RNA，抑制肠道脂肪吸收

针对微生物调控脂质代谢的非代谢物机制尚不清楚的问题，利用仔猪、小鼠及肠道类器官，探究丁酸梭菌（Clostridium butyricum）及其细胞外囊泡的作用。

仁济医院洪洁团队Nature子刊：两种“坏”菌互作驱动持久肠道动力障碍，益生菌或可破局

针对产肠毒素脆弱拟杆菌（ETBF）定植后肠动力障碍持续存在的机制不明问题，利用小鼠模型及多组学分析解析了细菌互作驱动的神经损伤通路。